Für den S-Bahn-Betrieb musste auch der Bahnhof Stadelhofen den erhöhten Anforderungen angepasst werden. Die grössere Zuganzahl erfordert ein drittes Gleis und einen schienenfrei zugänglichen Zwischenperron. Hauptbestandteil der baulichen Massnahme sind die zurückversetzte Stützmauer, die Galerie zur Überdeckung der bergseitigen Bahnanlagen, die neu erstellte Brückenverbindung und ein Ladengeschoss als Unterführung zum Zwischenperron.